DNN no permite la agrupación por temas/categorías, deberías modificar el código fuente pero hay que tener en cuenta que el módulo FAQs está integrado en el núcleo de DNN.
Por otro lado, en la Pregunta de la FAQ puedes incluir delante el Token [CATEGORYNAME]. Todas las FAQs se visualizarán con el nombre de categoría/tema delante. En el código fuente, concretamente en Desktop Modules/FAQs/Settings.ascx
En el "<asp:dropdownlist" agregamos el siguiente elemento:
<asp:ListItem Value="4" resourcekey="OrderBy.Text">Texto</asp:ListItem>
Una vez ya en el módulo accedemos a la página de Configuraciones y seleccionamos el elemento Texto en la lista desplegable de Ordenación.