Hola dormio, cuando creas la plantilla, se crea un .zip que desde host-->extensions instalas como una extenxión más, verdad?
Pues si vas a Admin-->skin podras seleccionar esa plantilla, y luego tendras que aplicarla. asi como los containers. es muy sencillo. y NO hace falta crear un sitio nuevo para aplicarla.
Yo realmente el artistereer lo uso como base, porque luego no te da la flexiblidad que algunos proyectos requieren, y para hacer eso, es necesario conocimientos de CSS y algo de HTML.
Supongo que dices que no se parece al diseño que creas en el artistereer, porque luego depende del contenido que tengas en tu portal.
Un saludo.